师资力量
郑双佳
助理教授,上海交通大学溥渊未来技术学院
博士,中山大学
访问学者,麻省理工学院
办公地点 :上海交通大学溥渊未来技术学院208
邮箱 :shuangjia.zheng@sjtu.edu.cn
个人简介

[申请博后/研究生/RA的同学请先看主页说明] https://zhenglab.sjtu.edu.cn/


教育背景

2020年-2023年,中山大学,计算机科学与技术,博士

2017年-2020年,中山大学,药学,硕士

2017年-2020年,南方医科大学,药学,学士

工作经历

2023年-至今,上海交通大学溥渊未来技术学院,长聘教轨助理教授

2023年-至今,麻省理工学院,访问学者

2020年-2023年,星药科技,副总裁

2019年-2020年,腾讯AI Lab,联合培养

研究领域

生成式人工智能

生物基座模型与多智能体系统

AI药物设计

AI合成生物学

所获荣誉

2024 亚洲青年科学家基金项目研究员

2024 福布斯亚洲30岁以下杰出人才榜(Forbes U30 Asia)

2024 中国人工智能学会(CAAI)优秀博士学位论文

2023 世界人工智能大会云帆奖

2023 吴瑞奖学金及吴瑞天使基金获得者

2022 百度奖学金

2021 世界人工智能大会青年优秀论文奖

学术兼职

CCF生物信息学“新未来”青年学者研讨会执行委员

上海生物信息学会青年委员会委员

人工智能顶会NeurIPS 2024领域主席(Area chair)

期刊审稿人: Nature Machine Intelligence, Nature Communications, Cell Genomics, Patterns, Bioinformatics, J. Chem. Inf. Model, J. Cheminformatics等

会议程序委员: ICLR 2022/2023/2024, NeurIPS 2023/2022/2021, ICML 2021/2022/2023/2024, KDD2024等

代表性论文(近3年的10篇)

Z. Wang, Y. Ji, J. Tian, S. Zheng*. Retrieval Augmented Diffusion Model for Structure-informed Antibody Design and Optimization. ICLR, 2025.

W. Lu, J. Zhang, W. Huang, Z. Zhang, X. Jia, Z. Wang, L. Shi, C. Li, P. Wolynes. S. Zheng*. DynamicBind: predicting ligand-specific protein-ligand complex structure with a deep equivariant generative model. Nature Communications. 2024.

C. Hua, B. Zhong, S. Luan, L. Hong, G. Wolf, D. Precup, S. Zheng*, Reactzyme: A Benchmark for Enzyme-Reaction Prediction. NeurIPS, 2024. (CCF-A)

J. Rao, J. Xie, Q. Yuan, D. Liu, Z. Wang, Y. Lu, S. Zheng*, Y. Yang*. A variational expectation-maximization framework for balanced multi-scale learning of protein and drug interactions. Nature Communications. 2024.

M. Li, X. Liu, H. Ji, S. Zheng*. Causal Subgraph Learning for Generalizable Inductive Relation Prediction. KDD. 2024 (CCF-A)

S. Zheng, Y. Tan, Z. Wang, C. Li, Z. Zhang, X. Sang, H. Chen, Y. Yang. Accelerated rational PROTAC design via deep learning and molecular simulations[J]. Nature Machine Intelligence. 2022.

S. Zheng, T. Zeng, C. Li, B. Chen, C. W. Coley, Y. Yang, R. Wu. Deep learning driven biosynthetic pathways navigation for natural products with BioNavi-NP[J]. Nature Communications. 2022.

S. Zheng, Y Li, S. Chen, J. Xu, Y. Yang. Predicting Drug Protein Interaction using Quasi-Visual Question Answering System[J]. Nature Machine Intelligence. 2020.

W. Lu, Q. Wu, J. Zhang, J. Rao, C. Li, S. Zheng*. TANKBind: Trigonometry-Aware Neural NetworKs for Drug-Protein Binding Structure Prediction[C]. NeurIPS. 2022. (CCF-A)

C. Xie, X. Zhuang, Z. Niu, R. Ai, S. Lautrup, S. Zheng, et al. Amelioration of Alzheimer’s disease pathology by mitophagy inducers identified via machine learning and a cross-species workflow[J]. Nature Biomedical Engineering, 2022.

讲授课程(近5年)

《深度学习》

《生物信息学》